德川幕府自从家康开府以来，传十五世，到此算是亡了。一个新的局面开始了。在这新局面开始前，日本受西洋各国的欺凌并不比中国所受的少。日本当时的志士也和中国的志士一样，气愤填膺想为国效命。但是日本却很容易地翻了身。中国则沉沦在病夫阶段将近宝贵的一百年，真不禁令人浩叹。我们不能不怪我们的同胞，习于安乐，一染上鸦片之害便不能自拔，以及文弱成风，没有那武士精神，不肯自我检讨，一篇八股文章断送了求新知识的欲望，而最令人气短的是不服从、不团结。在这一点上我们真愧对日本的志士。
日本新政府虽然已成立，但问题很多。这时在社会上由老百姓自动开始一种风气，叫作御一新运动。凡是洋人会的，他们无有不学。但是封建时代遗留下来好的德行，也无不保留。御一新成为明治维新的原动力，由政府开始颁布五条誓文，作为国家的基本方针：
一、广兴会议，万机决于公论。
二、上下一心，盛展经纶。
三、自官吏以至庶民，务使各遂其志，振奋人心。
四、破除旧有习惯，一切基之于天地之公道。
五、广求知识于世界，大振皇基。
这五条发布之后，紧接着又发布一条声明，天下所有权力悉归太政官，使政令无二出。这样使得各藩都没有发号施令之权，才能之士不能不到中央来，不但朝廷，连各藩都不能不彻底改革了。于是日本本来分得很清楚的地方色彩，自然打破，只要是人才，便可以在中央一显身手，不再有家世门阀之别了。关于这一点，我们中国早就没有阶级门阀。将相本无种，凭自己的本事来取功名，比日本进步多了。
所以倘若那时道光帝真能重用林则徐，则鸦片战争不至于发生，有眼光的林则徐，一定懂得应该强兵整军。他已经知道西洋枪炮的厉害，由很拮据的经费里拨出钱来买了一艘战舰坎布里奇号，如果能放手由他加强我们的武备，清廷必然可以中兴。再若如果慈禧能容同治或光绪来亲政，而不横加阻挠的话，中国的历史也一定要改写了。我们的为政者一而再误国，可胜浩叹。
明治天皇由聪明的岩仓具视以及三条实美等辅佐，仿效了西洋，把立法、行政、司法分成三个机关。行政官里只加添了一项西洋所没有的神祇，成立了上下两院来议事，废藩置县府，一切都抄袭了西洋的组织。日本很快变成一个像样的近代国家，不到十年已经完成了大业，开始学习西洋的作法，对周围的弱小地区露出狰狞的面貌来。千年以降，日本民族本是一个不怕死好勇斗狠的家伙，这时又手握着西洋式的精密武器，焉有不兴奋雀跃的。所以在这十年当中，也发生了一些不愉快的事件。明治二年二月，一位参与横井小楠要从官厅回家时，被六个暴徒当场斩杀。他虽然已经是六十多岁的老头子，但思想很新，看到美国华盛顿总统的榜样，认为非常理想。他精通汉学，认为华盛顿可以比美尧舜。可是那时社会上攘夷思想相当普遍，不允许有人赞美华盛顿，认为他是奸人。一个饱学之士，就这样冤枉死于乱刃之下。
由这一横井暗杀事件看来，日本那时还比中国落后。排外思想两国差不多，但是日本的为政者高高在上，知道向西洋学习只会有好处，不会有害处，所以不再盲目攘夷，不像中国慈禧太后，还停留在纯反洋思想。虽然那时很多重臣都明知反洋不是办法，但是慑于慈禧的横蛮无知，只有三缄其口了。
【迁都江户改名为东京】
明治二年还有一件大事，值得注意的是，虽然天皇已经正式迁都江户，改名东京，在改名的那一天，幕府的陆海军将士不得不含泪将武器点交给新政府人员。点交的时候，免不了要发生不愉快之事，很多幕府的老兵将不服气，暗暗地溜走了。他们对关东一带地方熟悉，盘据起来，开始打起游击战，骚扰地方，带给新政府不少麻烦。尤其本来驻屯在江户的彰义队有护卫庆喜、警备江户任务的，更是气愤填膺，反对新政府，不断攻击，使得新政府的威信一天比一天低落。
新政府后来发现关东地方骚动的原因，是因为幕府的老人没有受到妥善的安排，对于未来充满了怀疑与不安，颇有走到绝路的恐惧，所以才兴起了铤而走险的念头。明白了这一点之后，新政府便去找德川家的族人，把没收的土地一一发还，平息了他们心中的不满。果然反叛渐渐消灭，恢复平静。这项措置是战略家大村益次郎建议给新政府的。
本来聚集在上野的彰义队，一夜工夫就溃散了。
【会津藩之乱】
戊辰之战的初期，谁也没有想到会发展到全面战争。由仙台藩开始，东北各藩没有一个看得起萨、长两藩的。其中以会津藩的气势最盛，不惜和新政府拼一下。他的藩主松平容保由江户归藩时，买了不少外国最新武器，并且得到幕府留下的金钱、枪炮。那时幕府则采用法国式的新编制，编成了少年白虎队。队员一个个都非常精壮有朝气。和会津藩沆瀣一气的庄内藩，也是一个佐幕派，同样的，决心和新政府一战。冲突一开始，政府军便吃了败仗。新政府命令大总督反攻。于是大总督和参谋西乡隆盛协议，调派了海陆大军进剿，但反而被会津藩占领了白河城一个要冲地点。这时东北地区的各藩群起反抗新政府，成立了列藩同盟，以仙台为盟主，请由江户逃出来的轮王寺宫（亲王）当名义上的军事总督。至于政务则交由幕府两位老中板仓胜静和小笠原长行负责。他们并且拥有一个新港口新泻港。在这港口里，能与洋人贸易交换物品，尤其可以买到最新式的武器。战争一时陷入胶着状态。但双方打了七个月之后，忽然有了转机。政府军连战皆捷，各藩相继降服，只剩下会津一藩还在负嵎顽抗。一个月后，终于不能不投降。藩主松平容保和他儿子被俘，送到了东京。奥羽地方的诸藩好不容易平定。现在仅余盘据在五棱郭的榎本武扬了。
榎木武扬是前幕府总裁。幕府灭亡之后，他组织了虾夷政权，雄据一方。新政府不能不围剿，由美国买来四艘铁甲兵舰，四艘运输舰进攻，榎本军当然不敌。虽然也一度想夺取铁甲舰，派幕府的军舰回天去奇袭，但没有得手，舰长反而战死了。榎本据有五棱郭和两处炮台，但激战之后都被官军占领了。榎本看看大势已去，只好投降。这一仗给官军很大的信心，也引起了他们侵略的野心。