秀吉灭了柴田胜家，虽然祛除了唯一能对抗他的敌手，但究竟是长年的同袍弟兄，焉能不怆然神伤！对阿市更免不了歉然于怀，她所遗下来的三位孤雏，是她与前夫浅井之间所生的，大的只不过十四岁，一个个都十分清秀，楚楚动人。信长是个喜欢粗线条作风的人，动不动凶狠相向，但他的面貌却眉清目秀文诌诌的，不像是个杀人不眨眼的魔王。而他的同胞妹子更称得上是个绝代佳人，她这三位千金尤其最大的十分像她，使得秀吉不能不生怜爱之心，他于是将这三个孩子都收养了下来。
秀吉贫贱时，和前田利家、浅野长胜等共事信长，十分莫逆。浅野家里寄养了一个女儿，本姓杉原名八重，杉原家道本来小康，忽然中落，不得已将八重送来浅野家作为养女，长大之后艳美如花。前田利家前来求婚，不料为女所拒，浅野十分为难，因为他和前田是僚友，不好推辞，就将此事问计于秀吉。秀吉出了主意，假说她的生父母早就将她许配给了秀吉，所以不能做主，要由八重自己决定嫁给谁。前田心想我这堂堂七尺之躯，总比那瘦小如猢狲的秀吉强得多。他立刻赞成，并且请柴田胜家禀明了主公信长作证。秀吉本来也不敢有被美人垂怜的妄想，当时只不过借此打消前田求婚之意，想不到自己竟卷进这场恋爱竞争之中，更想不到会雀屏中选，八重选了猢狲样的他。
他家无长物，拿了破碗，喝了交杯酒，就这样成了婚。他们夫妇之间十分恩爱，只可惜天不作美，始终没有孩子。一晃秀吉已经年将半百，他的勋业不断地蒸蒸日上，而膝下犹虚，在无后为大的时代中，他心中不免怅惘。
秀吉击破柴田胜家之后，柴田的盟友泷川一益和信孝都还在负隅顽抗。信孝虽然三番两次忽战忽和，反覆无常，但和秀吉有极深的仇恨，断无妥协的可能。不过秀吉一时也奈何他不得，他是信长之子，秀吉是信长一手提拔起来的属员，在讲究主从之间的义气下，秀吉不敢对信孝有什么过份的举动。
不过参加到秀吉阵营里的信雄，对信孝就没有任何顾忌。虽属兄弟之亲，但非一母所生，而从小受尽信孝的欺凌、排斥，这时是他报复的机会。他将信孝围困在岐阜城中，城破，信孝脱身逃到了一个滨海地区的小城野间。信雄不肯放过他，迫他自刃而死。信孝行年只得二十六岁。
剩下来的泷川一益知道独力抗拒秀吉，只有自取灭亡。当年同在信长麾下的僚友，前田利家、佐佐成政等，都归顺了秀吉，秀吉对他们相当礼遇，泷川于是也干脆投降了。
这时织田信长的旧部诸将，表面上暂时都对秀吉俯首称臣，时为天正十一年的六月，距离本能寺之变，整整一年。
在这整整一年之中，秀吉的地位是肯定了。织田氏的天下，无疑地由他代替。勋业虽然日隆，而内心空虚。他与当时的诸大名将不同，是个身无立锥之地的人，虽然因立功而得到了很多封赏，实际上都没有任何渊源。这时他已四十八岁，连个固定的居处都没有。山崎是他西征归来时，临时歇脚、安顿家眷的地方，视野狭隘，绝不是个有气魄的地方。在他的家书中认为迁址为良，大阪才是理想的居处。
他因为八重没有生育，娶了前田利家的女儿为侧室。原本是情敌，却做了丈人的前田，是他最忠诚的朋友。贱岳之战时，前田本来是受柴田胜家节制，胜家兵败，秀吉单骑去追，驰过前田营前，大呼又左，又左一起去追，又左是前田的小名，从此前田成为秀吉的死党，将女儿嫁给了他之后更是亲密。秀吉所写的家书，就是写给他新纳的侧室前田摩阿的。
大阪确实是个可攻可守的好据点，和信长纠缠了十多年的石山本愿寺，就可以证明它的优秀性。秀吉于是大兴土木，除了建造了华丽璀巍的大阪城之外，又在四周开辟了很多条道路，以便容纳各地来朝的大名，由他们各自兴筑邸宅。大阪很快便形成了极繁荣的城市，与有长年商场历史背景的堺几乎连接了起来。秀吉本来就有科学管理头脑。在他初事信长的时候，曾经表现过优异的干才，一面倒塌了百步长的城墙，别人一个月都没有修成，由他经手后，两天完工。此时他动员了三万余人夫，日夜赶工，大阪焕然一新，几乎成为凌驾京都以上的大城。
六月初二信长逝世周年，一清早，秀吉在大德寺信长灵前焚香行礼后，便驰赴大阪。各方来祭奠的人已经寥寥无几。织田家的威望被人淡忘，秀吉射放出来的光芒，掩盖了他以前的旧主。趋炎附势自古皆然本不足怪，不过身历其境的人，往往会受不了。当时很多文士已经慨叹人情的冷酷，感受最灵敏的一个人，当然莫过于信雄。现在除了被秀吉拥立为织田家后继的三岁小儿，信长的嫡孙秀信以外，信长的诸子之中只剩他一个，应当被尊重，而谁都没有把他放在眼里。秀吉本人尤其似乎故意地冷淡他、疏远他，使他生闷气。而最使他不堪的，是他手下有四员大将，被秀吉邀了去，倾心相交，时常馈赠珍宝。其中一人，总觉得不自在，他于是将经过情形据实密报信雄，显然的秀吉有所图谋。信雄紧张起来，召集他们四人集议，准备对秀吉发动攻击，不料除告密者外，其他三人都异口同声表示反对，更证明了他们都偏袒秀吉，是秀吉的同路人，而不是他信雄忠实的部将。他一怒之下，便将这三员猛将都杀了。然后他去联合了德川家康，和秀吉翻脸为敌了。
德川家康还乡之后，知道将有大乱，便严守疆界，静以观变。在秀吉东西奔驰的一年中，他专心抚慰由各方流亡来的武士。
武田氏被织田信长父子灭亡之后，甲斐境内的武士一个个都无家可归，家康于是统统将他们收容了下来，组织了庞大的武士团。在苦难中有人出来援手，谁能不感激涕零。何况家康本人就是名闻遐迩的武士，他精于弓箭，有百步穿杨之能，当年武田信玄曾经推许他为东海第一箭手。被这样一位名将网罗为部属，不但幸运也十分荣耀。凡是投他帐下的，无不死心塌地为他效命。
在贱岳之战时，柴田胜家一度邀他共讨秀吉，他还没有决定究竟该袒向那一面时，柴田已经溃灭。
信雄和他接近，主要原因是领域相连，休戚相关，同时也仰望家康的为人。秀吉探到信雄和家康会合来攻的消息，也立刻动员，由大阪到了京都。这次他在名义上屈居下风，舆情认为是他在欺凌故主的后裔，他自己也有理屈之感。因此他特别小心来调度他的精锐。信雄、家康这一面，当然更不敢掉以轻心，秀吉自领兵作战以来，还很少败过阵。
信雄起兵之日，昭告各方，声明已与秀吉绝交，数了他的罪行，并且借信长的旧谊余恩，希望各地诸侯共讨秀吉。秀吉也不甘示弱，他飞檄他的盟友上杉景胜，邀他夹击家康。
在诸战中，秀吉连连得利。不过在争夺最重要的一个高地时，他晚了一步。小牧山居高临下，支配了尾张的整个原野，被家康抢了先占据了。战况形成了胶着状态。秀吉的大军不敢仰攻，秀吉部下大将池田恒兴建议绕道偷袭家康的根基三河，家康若来驰救时，小牧山的守备自然减弱，一举可以攻克。倘若不来救时，三河必垮无疑。这当然像是上策，不过分兵绕道，也不能不算是一着险棋。秀吉本来不肯，但拗不过众将的恳请，只好同意了。他于是分兵四队，以池田恒兴为第一队先锋，第四队由他的外甥秀次率领为总大将断后。他自己仍然率领精兵监视着小牧山的动静。
先锋池田恒兴夜半出发绕向三河，中途遇到了一个小城挡着去路，其实他应该派一小部兵丁将该城围困起来，大队人马仍然继续前进才是。但因他的乘马为城中枪弹打中而死，他一时气愤，非攻破该城不可，哪知守将非常英勇，足足守了三昼夜，才被攻破。这时家康已经在两天前获得情报，他也不声不响抽调了一支精兵，亲自率领，先打垮了秀次，再追上池田恒兴，把他杀了。池田的计策虽然没有错，但他行动太慢，孤军深入，陷进四面受敌的境地，自取覆亡。
秀吉吃了败仗之后，不再死拼。他整军而退，归途中，他还攻克了属于信雄的几座城池，以作日后讲和的交换条件。
家康也同样作风，在收兵之余也夺了尾张的蟹江城，打败了老将泷川一益。泷川斗志消沉，索性投降了，家康对他十分礼遇，遣送他回京都。
秀吉这时周围的情势十分不稳，南海方面的海盗非常猖獗，数犯岸边诸城，同时在土佐的强豪，名叫长曾我部的，居然吞并四邻，成为日本四国的霸主。他经常怂恿海盗，资助他们来骚扰沿海都市，甚而威胁到大阪的安全。如果秀吉和家康长期争衡的话，就可能招致四面受敌。因此秀吉急于求和。
信雄领兵驻屯在伊势的桑名，和秀吉的大军对峙。信雄的部下面对着秀吉的常胜军，精神上感受无比的压力，往往一日数惊。秀吉侦知到这情形之后，便派人去见信雄，婉转地对他说：我替令尊大人报了仇，镇定国家，各位郎君反而听了谗言，要置我于死地，我不能不起而较量。信孝君之死，我至今难过。我们本来可以共享富贵，为什么信雄君因为一点不愉快就动起火来，跟我过不去呢！他这番话传过去之后，信雄立刻表示愿和。于是两人约定在桑名的一个小地方相见，秀吉赠送给信雄一把宝剑，双方罢兵，言归于好。
虽然在小牧山之役，家康是对抗秀吉大军的主将，但讲和时他根本没有露脸，也没有任何要求或意见，完全听命于信雄。秀吉要求以家康的次子为质，在当时的习惯是双方缔和的保障，家康本来不肯，由于信雄的斡旋，秀吉认了这孩子为义子，解除了当人质的意味，并取秀吉家康各一字为名叫秀康，后来成为松平氏的始祖。
议和成立后，秀吉便要专心对付那些背叛他的人，除了南海的海盗和四国的长曾我部之外，还有佐佐成政。成政在贱岳之战后，投诚过来，秀吉念在同袍之谊上，委任他为越中管领。信雄与秀吉发生龃龉时，成政又投到了信雄这一面。成政的反覆无常，令秀吉十分憎恶，要惩罚他。
但是秀吉首先扫荡了南海的海盗，然后又解决了长曾我部，容他投降，将他的领土分封了有功的将士。然后进剿佐佐成政。
成政是个有野心的人物，喜权术，他觊觎前田利家的领地加贺。假意求亲，说家无男嗣，希望利家的次子入赘过来。利家当然高兴。幸而有人告密，说他不怀好意是要乘机来偷袭。果然他带领了大军侵入加贺，围攻末盛城。幸已有备，守将奥村永福与妻共同守城，一个弱女子束发提刀来激励士卒，使得军心大振，利家的援军又及时赶到，把成政杀得大败。成政听到信雄与秀吉言和的消息，大惊，知道秀吉一定不会轻易饶了他，便连夜越过崇山峻岭驰赴远江求见德川，希望家康收回成约，继续战斗，但被家康拒绝了。他又往见信雄做同样要求，信雄也以和议已成，不能反悔。成政无可奈何，只好将所有的防卫撤走，自己削了发表示决心出家，等候秀吉对他的处置。秀吉本来命他切腹自杀，由于信雄的求情饶他不死。
这样，秀吉将小牧山之战时，凡是乘机背叛他、骚扰他、扯他后腿的家伙，一个个都惩戒完毕。
秀吉的官运，随着他的勋业，青云直上。在举行织田信长葬仪的时候，天皇第一次叙他的官位为从五位下的左近卫权少将。第二年贱岳之战后，是从四位下参议，小牧山之役时，已是从三位权大纳言了。这官阶已经等于征夷大将军。
他由战场凯旋回到京都时，恰逢天皇古稀寿辰，天皇有意禅位给皇太子，秀吉赶不及地动员了人夫在仙洞替即将禅位的天皇营建宫室，天皇为了酬谢他，再升任他为正二位的内大臣。信长生前最高的官位是从二位右大臣。他的地位和他的故主相埒了。
秀吉出身微贱，没有读过什么书，对于官阶不甚了了。往日的印象，总以为征夷大将军才是最显赫的职位，因此他想求为将军。他的好友右大臣藤原睛秀劝他说，将军不值什么钱，朝廷里最高的官职是关白，位亚天子，统御百官。秀吉大喜，他要求任关白了。这时现任的关白是藤原昭实，昭实只好让位，几百年来由藤原家独占了的关白，由一个没有姓氏的人顶了过去，朝野大哗。当时对于这样革命性的异动，几乎承受不了，在惊愕当中，希望秀吉冒姓藤原，或源，或平，或任何有来历的姓氏。秀吉到底姓什么他自己也弄不清楚，他的后父姓木下，追随信长时，以木下秀吉的姓名相从，屡建战功后，信长令他自选一个有来历、更响亮的姓，于是改为羽柴，而羽柴是丹羽、柴田两姓的合并拼凑，不伦不类，不登大雅，实在不能用。秀吉脾气倔强，不肯顶用人家的姓氏，结果只有奏请天皇赐姓。在天正十三年的九月九日颁下了新撰的佳姓为丰臣。于是以丰臣秀吉的姓名就任为关白。时为西历的一五八五年，他五十岁。